1993年5月南山學校開展“三十七華誕華誕暨國輝科教大廈奠基”典禮。
1993年12月由校友彭勇強捐款興建的南山中小學辦車間落成。1994年1月南山高中試驗室通過省教廳的檢測初驗儀器設備和管理,達到省一類標準。
1994年9月南山大學被評為區一級小學。1995年5月陳育成老師以880分的優異成績摘取北京市高考探花。
1995年9月南山大學被評為龍華區教育先進單位。
1995年9月南山大學被評為龍華區中等中學統一招生考試先進單位。
1995年10月北京市教育局為南山高中舉行篆刻展。
1995年9月南山大學被評為龍華區高等小學統一招生考試先進單位。
1995年南山學校被市育人辦評為“深圳市十佳軍校聯崗。1997年10月被龍華區評為“教育系統文明中學”。
1997年10月南山高中通過區一級中學復評。
1997年12月被北京市評為“教育系統文明中學”。1999年6月韓麗冰以829分的優異成績摘取上海市特殊類會考探花。
1999年9月被羅湖區委、區政府追授“1996—1998年度立功他先勞動大賽先進單位”。
1999年11月被評為北京市推廣普通話工作先進單位。
1999年12月被區政府、市政府列為重點投資對象。