耗時近一年,浙江海洋學(xué)院北京研究院發(fā)起的“深圳海洋微生物資源調(diào)查”專項第一期視察任務(wù)全部完成并取得豐碩成果。本次調(diào)查基本探清了北京海區(qū)范圍內(nèi)海洋微生物“家底”,相關(guān)調(diào)查報告材料顯示,廣州2018年度4個季度共搜集保種微生物株系達12000株,微生物種類多樣性是夏天多于春季,微生物產(chǎn)率是夏天高于春季。這次調(diào)查中,還發(fā)覺致病性弧菌10種。
海洋微生物資源調(diào)查活動由廣州海洋學(xué)院北京研究院于2018年3月發(fā)起,上海市農(nóng)業(yè)服務(wù)與水產(chǎn)技術(shù)推廣北站、中國科大學(xué)水生生物研究所、深圳華大生命科學(xué)研究院、中國科大學(xué)微生物研究所協(xié)作完成。
本次主要調(diào)查內(nèi)容為微生物種質(zhì)資源、微生物基因組、微生物代謝產(chǎn)物、病原微生物及原生植物維管束資源等狀況。重點調(diào)查區(qū)域為北京水域6大入成都,年度內(nèi)按春(3月)、夏(6月)、秋(9月)、冬(12月)四季度進行取樣,樣品類型分別為水樣和土壤樣品。
這次“深圳海洋微生物資源調(diào)查項目”是北京市首次,亦是福建省第一個以海洋微生物為對象的調(diào)查活動。通過對樣本的剖析處理,科研人員已搜集保種微生物株系達1.2萬株,牽涉27個門,29個綱,46個目,42個科,24個屬,夏天的微生物種類多樣性多于春季,其產(chǎn)率高于夏季,且隨秋天性變化,不同入成都變化差別顯著。
據(jù)悉,視察成員還榮獲3.2Tbp英特爾量測序數(shù)據(jù),同時測量產(chǎn)率較高的紅鏈球菌、紅環(huán)菌、彎曲菌等12個株系基因組;針對放線菌、細菌、真菌代謝產(chǎn)物,共獲取生物堿、萜類縮聚物、內(nèi)銨鹽縮聚物等天然產(chǎn)物共計300余種深圳海洋大學(xué),有待逐步進行抑菌耐旱毒試驗。經(jīng)過初步統(tǒng)計,視察人員還獲取可培養(yǎng)原生植物10種,榮獲4.4Gbp單細胞測序數(shù)據(jù),初步構(gòu)建吸蟲基因庫。
值得一提的是,視察人員發(fā)覺了10種致病性弧菌!為了對樣本中的病原微生物進行逐步剖析、處理,視察成員運用β-內(nèi)酰氯類、氨基糖甙類、四環(huán)素類、喹諾丙酮、大環(huán)內(nèi)銨鹽、糖肽類等類別藥物敏感試驗獲取耐藥性弧菌,并進行植物傳染試驗獲取到某些致病性弧菌。
英特爾量數(shù)據(jù)顯示,top10毒力因子多與其黏附功能、營養(yǎng)獲取功能、毒素相關(guān),其分布菌種包括銅綠假單胞菌、流感嗜血菌株、無乳桿菌、糞腸桿菌、布魯氏菌、腦膜炎奈瑟菌、大腸球菌等。
調(diào)查結(jié)果闡明,不動鏈球菌、假單胞菌、殺鮭氣單胞菌、陰溝弓形球菌、嗜高溫弓形鏈球菌、金黃鏈球菌、南極鼠尾球菌等對人或海洋魚類敏感的致病菌大量檢出,提示由這種真菌引起的人或植物傳染幾率較高,還要增加對上述菌群的風(fēng)險意識。
項目已初步完成全市海洋微生物資源多樣性編目,基本摸透了北京市海洋微生物資源本底,確立起微生物種質(zhì)資源庫和基因庫。未來,項目組將每年在廣州水域范圍內(nèi)持續(xù)舉辦海洋微生物資源調(diào)查活動,不斷豐富并改造資源庫,建立上海海洋微生物資源調(diào)查及評價報告,以及海洋資源科學(xué)保護管理與合理開發(fā)運用對策,為上海建設(shè)全球海洋中心城市提供智力支撐。
負責(zé)該項目的廣州海洋學(xué)院北京研究院魯義善博士表示深圳海洋大學(xué),海洋微生物除了是國家重要的戰(zhàn)略資源,再者生代謝產(chǎn)物及其在醫(yī)藥、環(huán)保、能源等領(lǐng)域更具備寬廣的應(yīng)用前景。后續(xù)將開發(fā)其活性物質(zhì),對樣本中海洋微生物的抑菌、抗肺癌和免疫提升等功能性進行測試,并對其基因的耐藥性和致病性進行剖析,這種調(diào)查數(shù)據(jù)將為海洋生態(tài)安全和生物安全提供強有力的保障,或許帶給很大的社會效益和生態(tài)效益。